张锋实验室授权/改造SpCas9,降低脱靶效应
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金斯瑞提供的CRISPR材料来源于张锋实验室,所提供的CRISPR产品和服务得到美国Broad研究所授权许可。包括:
金斯瑞提供超20,000种含有gRNA序列的plentiCRISPRV2质粒,所有sgRNA序列已经被MIT验证。在数据库中,您可通过搜索基因名称,基因标志或ID来查找相关gRNA。
服务 | 递送方式 | 筛选标记 | |
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GenCRISPR质粒库 | Lentiviral | Amp,Puro | gRNA数据库 |
为满足您多种需求,金斯瑞不仅提供多种Cas9类型的定制质粒,也提供经由MIT验证的空载供您选择。
根据Cas9类型,定制质粒包含如下几种:
1. 增强CRISPR/SpCas9质粒-eSpCas9New
特异性增强SpCas9(Enhanced specificity SpCas9,eSpCas9),指的是SpCas9(K848A/K1003A/R1060A),是经过MIT张锋实验室特异性改造的质粒(Slaymaker et al. 2016).eSpCas9可以降低脱靶效率,比自然SpCas9脱靶效率降低10倍之多,同时可实现基因高效编辑。
Cas9基因组编辑依赖于DNA双链的分离。sgRNA与非靶向DNA序列的不匹配可能导致非特异性结合和分裂。为了提高基因组编辑的特异性,科学家开发了突变为K848A、K1003A和R1060A的eSpCas9。在SpCas9的非靶链沟槽内中和这些带正电荷的残基,既可以减少非靶结合,也可以刺激靶向结合,这一操作需要更严格的Watson-Crick碱基配对。
服务 | 递送方式 | 筛选标记 | |
---|---|---|---|
eSpCas9质粒 | Plasmid Lentiviral |
Puro GFP |
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2. SpCas9质粒Hot
Cas9内切酶是基因编辑的研究标准。当与单导RNA(single guide RNA,sgRNA)序列结合时,这些酶在基因组中产生位点特异性双链断裂(double strand breaks,DSBs)。
服务 | 递送方式 | 筛选标记 | |
---|---|---|---|
SpCas9 Plasmids | Plasmid Lentiviral AAV |
Amp Amp,Puro Amp,Neo Amp,GFP |
获取报价 |
3. SpCas9 Nickase质粒
SpCas9 nickase(Cas9n D10A)包含一个突变,不同于SpCas9切割时形成DSB,SpCas9 nickase在切割序列时形成单链缺口。经过SpCas9 nickase切割后,两个相对的gRNA序列可以有效配对,因为这种方法可以避免不必要的插入。
服务 | 递送方式 | 筛选标记 | |
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SpCas9 Nickase Plasmids | Plasmid Lentiviral |
Amp Amp,Puro Amp,GFP |
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4. SaCas9质粒
黄色葡萄球菌Cas9同源体(Staphylococcus aureus Cas9 orthologue,SaCas9)是腺相关病毒(adeno-associated virus AAV AAV)应用的理想内切酶。SaCas9比SpCas9大约短1kb,这允许了在AAV组装时更加灵活。AAV载体较低的免疫原性,使SaCas9非常适合于体内编辑的。
服务 | 递送方式 | 筛选标记 | |
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SaCas9 plasmids | AAV | Amp | 获取报价 |
5. 转录激活(Transcription Activation,SAM)质粒
CRISPR/Cas9协同激活介质(SAM)系统已被设计用于激活下游目标的转录。SAM系统使用三种不同的激活因子,VP64、P65和HSF1,它们被组装到催化失活的Cas9(dead Cas9,dCas9)复合物上驱动转录。
服务 | 递送方式 | 筛选标记 | |
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SAM gRNA Plasmids | Plasmid Lentiviral |
Amp Amp,Zeo |
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SAM dCas9-VP64 Plasmids | Lentiviral | Amp,Blast Amp,GFP |
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SAM MS2-P65-HSF1 Plasmids | Lentiviral | Amp,GFP Amp,Hygro |
获取报价 |
为满足您的科研需要,金斯瑞提供空载服务,载体序列已经由MIT验证。这些载体包含一个17bp-1.8kb的可表达连接体,以代替定制的sgRNA序列,您可根据需要对其进行修改。
服务 | 载体 | Cas9/gRNA表达系统 | 递送方式 | 载体类型 | 筛选标记 |
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eSpCas9 Plasmids | eSpCas9-2A-GFP (PX458) New! | eSpCas9 & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR EGFP |
eSpCas9 Plasmids | eSpCas9-2A-Puro (PX459) V2.0 New! | eSpCas9 & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
eSpCas9 Plasmids | eSpCas9-LentiCRISPR v2 New! | eSpCas9 & gRNA | Lentiviral | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Plasmids | pSpCas9 BB-2A-GFP PX458 | SpCas9 & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR EGFP |
SpCas9 Plasmids | pSpCas9 BB-2A-Puro (PX459) v2.0 | SpCas9 & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Plasmids | pLentiCRISPR v2 | SpCas9 & gRNA | Lentiviral | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Plasmids SpCas9 Nickase Plasmids |
pLentiGuide-Puro | gRNA Only | Lentiviral | Dual Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Plasmids | pLentiCas9-Blast | SpCas9 Only | Lentiviral | Dual Vector | AmpR BsdR BleoR |
SpCas9 Plasmids | pLentiCas9-EGFP | SpCas9 Only | Lentiviral | Dual Vector | AmpR EGFP |
SpCas9 Plasmids | pGS-gRNA | gRNA Only | Plasmid | Dual Vector | AmpR |
SpCas9 Plasmids | pGS-gRNA-Neo | gRNA Only | Plasmid | Dual Vector | AmpR NeoR |
SpCas9 Plasmids | pSpCas9 PX165 | SpCas9 Only | Plasmid | Dual Vector | AmpR |
SpCas9 Plasmids | pAAV_SpGuide acceptor (PX552) | gRNA Only | AAV | Dual Vector | AmpR EGFP |
SpCas9 Plasmids | pAAV-SpCas9 PX551 | SpCas9 Only | AAV | Dual Vector | AmpR |
SpCas9 Nickase Plasmids | pSpCas9n BB PX460 | SpCas9 Nickase & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR |
SpCas9 Nickase Plasmids | pSpCas9n BB-2A-GFP PX461 | SpCas9 Nickase & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR EGFP |
SpCas9 Nickase Plasmids | pSpCas9n BB-2A-Puro (PX462) V2.0 | SpCas9 Nickase & gRNA | Plasmid | All-in-one Vector | AmpR PuroR |
SpCas9 Nickase Plasmids | pLentiCas9n-Blast | SpCas9 Nickase Only | Lentiviral | Dual Vector | AmpR BsdR BleoR |
SaCas9 Plasmids | pX601_AAV | SaCas9 & gRNA | AAV | All-in-one Vector | AmpR |
Transcription Activation (SAM) | pSgRNA(MS2) | gRNA Only | Plasmid | SAM Multi Vector | AmpR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_sgRNA(MS2)_zeo | gRNA Only | Lentiviral | SAM Multi Vector | AmpR ZeoR BleoR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_dCas9-VP64_Blast | Cas9 Activator | Lentiviral | SAM Multi Vector | AmpR BlastR BleoR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_dCas9-VP64_GFP | Cas9 Activator | Lentiviral | SAM Multi Vector | AmpR EGFP BleoR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_MS2-P65-HSF1_Hygro | Activator Adapter | Lentiviral | Multi Vector | AmpR HygroR BleoR |
Transcription Activation (SAM) | pLenti_MS2-P65-HSF1_GFP | Activator Adapter | Lentiviral | Multi Vector | AmpR EGFP BleoR |
Cas9内切酶来源于II型CRISPR系统。化脓性链球菌(SpCas9)是第一个为哺乳动物基因组编辑Cas9酶。当与gRNA序列结合后,这些酶可以在特定位点上进行基因组双链断裂。因其简捷性,特异性以及高效性,CRISPR/Cas9系统在基因组编辑中广泛使用,金斯瑞提供Broad研究所验证的WT SpCas9可用于哺乳动物基因组编辑。WT SpCas9的交付载体有两种形式,All-in-one和Dual类型,可用于非病毒性,慢病毒型lenti-viral,以及腺相关病毒(AAV)的转染。其中,慢病毒类型兼容第二代和第三代慢病毒包装质粒。
虽然CRISPR/Cas9技术与其他基因编辑技术相比是比较明确的,但是脱靶仍然是一个难题。为了提高特异性,科学家们对Cas9核酸内切酶进行了修改。WT Cas9有两个催化域, RuvC 和 HNH,在这些域中进行催化残基突变(特别是RuvC D10A和HNH H840A),形成单链缺口与双链断裂(Ran et al,2013)。这些Nickase Cas9酶,或Cas9n,由gRNA引导至靶基因组DNA的另一端。细胞将通过HDR优先修复这些SSBs而不是NHEJ。通过HDR机制可以将降低脱靶效应。金斯瑞为您提供Broad研究所验证的Nickase Cas9助力您在哺乳动物细胞里的基因编辑。
从金黄色葡萄球菌或SaCas9中提取的Cas9同源物与SpCas9具有相似的效率;然而,SaCas9长度比SpCas9大约小于1kb。SaCas9的主要优势是腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)包装:AAV的载体大小约为4.5kb,因此将SpCas9与AAV包装在一起可能具有挑战性(Ran et al.,2015)。相对较小的SaCas9利用AAV载体进行CRISPR基因编辑成为可能。考虑到这一结构的免疫原性较低,因此SaCas9更适合于体内编辑应用,如用于治疗。
CRISPR/Cas9 Synergistic Activation Mediator(SAM)是一种蛋白质复合物,可增强内源性基因(一次一个基因,或同一细胞中同时有多达10个基因)的转录。SAM利用Cas9核酸酶的特异性和易用性,通过gRNA将Cas9核酸酶定位于内源性基因组的特定位点。Genscript与Broad Institute*签订了许可协议,提供经过验证的SAM gRNA序列,可针对人类基因组中的任何编码区域,并为任何其他物种提供免费的SAM gRNA设计服务。
SAM复合体由三个组件组成
如果对于CRISPR 质粒有任何问题或建议,请联系金斯瑞专业技术支持人员。